秦灶街道办事处内设内设综合办公室、党建工作办公室、农村工作和社会事业发展办公室（退役军人服务站）、政法和社会管理办公室、综合行政执法和安全生产监督管理办公室、建设工作办公室、社会治理现代化指挥中心7个职能机构。